El Hospital Clínico San Borja Arriarán es un establecimiento autogestionado en red del sistema público de salud. Con 250 años de trayectoria asistencial y de docencia, somos parte de la historia de la salud chilena.
El actual hospital nace de la fusión de dos grandes e históricos establecimientos como fueron el Hospital San Francisco de Borja y el Hospital Manuel Arriarán. El primero comenzó a funcionar el año 1772, en una gran casona emplazada en lo que hoy son las calles Alameda con Dieciocho. En sus inicios contaba con 20 camas y daba atención exclusiva a mujeres. Dadas las necesidades sanitarias de la época, se trasladó en 1847 a Alameda entre Portugal y Av. Vicuña Mackenna.
En 1910 se inició la construcción del Hospital de Niños Manuel Arriarán en nuestra actual ubicación en Avenida Santa Rosa. Posteriormente, a inicios de 1976, se fusionan los dos hospitales pasando a denominarse Hospital Paula Jaraquemada. El año 1990 nuestra institución cambia de nombre a Hospital Clínico San Borja Arriarán. Adosado éste, en 1998 entró en funcionamiento el Centro de Diagnóstico y Tratamiento (CDT) que alberga las atenciones de policlínico ambulatorio.
En 2002 cambió nuevamente su nombre y se denominó Complejo de Salud San Borja Arriarán. En 2011 retomó el nombre de Hospital Clínico San Borja Arriarán, con el fin de relevar la relación docente asistencial de este Centro de Salud.